מכללת אפקה מעודדת מצוינות אישית והצטיינות אקדמית, משלב הקבלה ללימודים ובמשך תקופת הלימודים. בכל שנה, מחלקת המכללה, מלגות הצטיינות לסטודנטים מן המניין, על סמך הישגיהם בשנה האקדמית החולפת.
במכללה מסלול מיוחד למצטיינים – "אפקה מצטיינים". המסלול כולל חשיפה מקיפה לתעשיית הטכנולוגיה ולמחקר עדכני, התמחות הנדסית בתקופת הלימודים ומלגות הצטיינות מורחבות. מכללת אפקה שמה לעצמה למטרה לעודד מצוינות בקרב הסטודנטים. מדי שנה, מעניקה המכללה מאות מלגות לסטודנטים בעלי הישגים גבוהים בלימודים.
נוהל הענקת מלגות הצטיינות