תנאי הקבלה ללימודים לקראת תואר שני בהנדסת מערכות:

בוגרי תואר B.Sc בהנדסה או במדעים מדויקים (פיזיקה או מדעי המחשב) ממוסד אקדמי מוכר להשכלה גבוהה בארץ או בחו"ל, בממוצע 80 לפחות. 

קבלה על בסיס ניסיון תעסוקתי - מועמדים בעלי ניסיון של שנה ומעלה בסביבה פרויקטאלית טכנולוגית רלוונטית וממוצע ציונים של 75-80, שיעברו בהצלחה ראיון אישי עם ראש התוכנית.