המכללה האקדמית אפקה שמה לה למטרה לעודד ולטפח פעילות מחקרית של אנשי הסגל.
המכללה רואה בקיום המחקר על ידי אנשי הסגל השקעה איסטרטגית לטווח ארוך ממנו יצאו נשכרים הסטודנטים, אנשי הסגל והמוסד עצמו.
קיום מחקר באפקה מסייע בקידום וטיפוח הסגל האקדמי, מאפשר למרצים לעסוק בנושאים שהם בחזית המדע והטכנולוגיה, מעודד קשר עם התעשיה, וממצב את המכללה האקדמית אפקה כמוסד הוראה ומחקר מצוין.
במכללה פעילה ועדת מחקר ששמה לה למטרה לעודד את חברי הסגל והסטודנטים לעסוק במחקר, לתרום לאווירת פתיחות וחדשנות במכללה, לסייע בהגשת בקשות לקרנות מחקר לקבלת תקציבי מחקר ולעודד לעודד פרסום מאמרים בעיתונות המקצועית.
במקביל המכללה משקיעה בכלים ותשתיות לחוקרים המאפשרים פעולה הדדית פורה בין החוקרים מהדיסציפלינות השונות.
במכללה מתקיים מחקר בנושאים רבים ומגוונים, ותעיד על כך רשימת הפרסומים בעיתונות המקצועית הבינלאומית של החוקרים במכללה. את תחומי המחקר הספיציפיים של כל אחד מאנשי הסגל ניתן לראות בדף חוקרים באפקה.